Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTTNBP2Q8WZ74 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms