Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL2Q8NHH9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL2Q8NHH9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms