Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POMGNT2Q8NAT1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POMGNT2Q8NAT1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms