Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL3Q8N8U3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms