Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP13Q86W25 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms