Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CMC1Q7Z7K0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms