Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NUP54Q7Z3B4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP54Q7Z3B4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms