Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms