Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SDK2Q58EX2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SDK2Q58EX2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms