Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms