Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf17Q53FE4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms