Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDCCQ504Y2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDCCQ504Y2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms