Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms