Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RFX4Q33E94 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms