Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HFEQ30201 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HFEQ30201 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HFEQ30201 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms