Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms