Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSNAXIP1Q2TAA8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms