Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RRN3P1Q2M238 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RRN3P1Q2M238 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RRN3P1Q2M238 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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RRN3P1Q2M238 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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