Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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