Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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