Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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