Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZFHX3Q15911 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms