Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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EFNB3Q15768 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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EFNB3Q15768 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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EFNB3Q15768 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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EFNB3Q15768 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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EFNB3Q15768 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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EFNB3Q15768 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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EFNB3Q15768 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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EFNB3Q15768 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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