Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms