Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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