Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms