Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms