Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMS2P11Q13670 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms