Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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HTR4Q13639 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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HTR4Q13639 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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HTR4Q13639 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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HTR4Q13639 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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HTR4Q13639 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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HTR4Q13639 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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HTR4Q13639 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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