Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CDH18Q13634 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CDH18Q13634 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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