Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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