Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PEX6Q13608 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PEX6Q13608 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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