Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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C1orf61Q13536 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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C1orf61Q13536 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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C1orf61Q13536 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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C1orf61Q13536 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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C1orf61Q13536 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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C1orf61Q13536 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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