Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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