Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDAP1Q13442 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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