Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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