Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALCOCO2Q13137 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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