Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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NPRL3Q12980 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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NPRL3Q12980 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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NPRL3Q12980 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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NPRL3Q12980 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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NPRL3Q12980 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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NPRL3Q12980 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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NPRL3Q12980 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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NPRL3Q12980 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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