Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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NFIAQ12857 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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