Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIF5AQ12840 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KIF5AQ12840 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms