Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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KCNMA1Q12791 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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KCNMA1Q12791 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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KCNMA1Q12791 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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KCNMA1Q12791 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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KCNMA1Q12791 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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KCNMA1Q12791 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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KCNMA1Q12791 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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