Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms