Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDE4DQ08499 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms