Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms