Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms