Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC18A2Q05940 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms