Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms