Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPEQ02224 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms