Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms