Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms